Se encuentran grandes formaciones de manglares en estuarios de los ríos Mataje-Santiago-Cayapas, Muisne, Cojimíes, Chone, Guayas, y Jubones-Santa Rosa-Arenillas. No obstante, la zona más extensa de manglares se encuentra en el estuario del rio Guayas y el golfo de Guayaquil