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Se desconoce la causa exacta de la narcolepsia. Las personas con narcolepsia tipo 1 tienen niveles bajos de la sustancia química hipocretina. La hipocretina es un neuroquímico importante del cerebro que ayuda a regular la vigilia y el sueño MOR (movimientos oculares rápidos).
Los niveles de hipocretina son particularmente bajos en las personas que experimentan cataplejia. Se desconoce qué causa exactamente la pérdida de células productoras de hipocretina en el cerebro, pero los expertos sospechan que se debe a una reacción autoinmune.
También es probable que la genética influya en el desarrollo de la narcolepsia. Pero el riesgo de que un padre transmita este trastorno a un hijo es muy bajo, solo alrededor del 1 %.
Según las investigaciones, también existe una posible asociación con la exposición al virus de la gripe porcina (gripe H1N1) y una cierta forma de vacuna H1N1 que se administra actualmente en Europa, aunque aún no está claro por qué.