La palabra "café" no tiene prefijos ni sufijos en su forma actual. Es una palabra de origen francés que se ha incorporado al español tal cual.
Para aclarar:
Prefijo: Un prefijo es un morfema que se añade al principio de una palabra para modificar su significado. Ejemplos de prefijos en español son "re-" (rehacer) o "pre-" (prevenir). La palabra "café" no lleva un prefijo en su forma básica.
Sufijo: Un sufijo es un morfema que se añade al final de una palabra para cambiar su significado o su categoría gramatical. Ejemplos de sufijos en español son "-ción" (información) o "-oso" (hermoso). La palabra "café" tampoco lleva un sufijo en su forma básica.